title: “Introducción a la ciencia reproducible con R” subtitle: “Document Freedom Day - OSLUGR” author: “Francisco Charte (@fcharte, fcharte.com)” date: “25 marzo 2015” output: beamer_presentation theme: dresden colortheme: dolphin

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En qué consiste la ciencia reproducible

Datos disponibles y accesibles

En qué consiste la ciencia reproducible

Procedimientos, algoritmos y herramientas disponibles y accesibles

En qué consiste la ciencia reproducible

Las acciones manuales no son fácilmente reproducibles

Introducción a R

Importación de datos - Desde archivos

• CSV: read.table()
• Paquete foreign
  • Stata: read.dta()
  • SPSS: read.spss()
  • SAS: read.ssd()
  • dBase: read.dbf()
  • ARFF: read.arff()
  • Octave: read.octave()
• Excel: loadWorkbook() - Paquete XLConnect
• OpenOffice/LibreOffice: read.ods()- Paquete ROpenOffice
• XML: xmlParse() - Paquete XML

Importación de datos - Desde bases de datos

• SQLite: RSQLite
• Oracle: ROracle
• MySQL: RMySQL
• PostgreSQL: RPostgreSQL
• ODBC/JDBC: RODBC/RJDBC
• MongoDB: rmongodb
• CouchDB: R4CouchDB
• Cassandra: RCassandra

Importación de datos - Otras fuentes

• Hadoop: RHadoop
• Spark: SparkR
• JSON: jsonlite
• Web: parseHTML() y readHTMLTable() - Paquete XML
• Web: GET() - Paquete httr
• Web: getURL()y getForm() - Paquete RCurl

Importación de datos - Ejemplo

Tags de los posts del foro de cocina de Stack Exchange

\begin{columns}[c] \begin{lstlistings} library(XML) library(tm) content <- xmlTreeParse(filename) \end{lstlisting}

\end{columns}

Publicación de datos